19-21 марта 2012 года в Париже состоялся Международный Конгресс Human Microbiome, организованный международным консорциумом MetaHIT

Основной задачей Конгресса было поставлено формирование общих принципов и роли микробиома человека в поддержании его здоровья, этиологии заболеваний и использования этих знаний для совершенствования профилактических и терапевтических мер. Результаты большинства метагеномных исследований микробиоты (триллионы микробных клеток и генов в организме человека)  потенциально открывают новые возможности для диагностики и лечения широкого спектра патологий. Julian Davies, микробиолог Университета British Columbia (Ванкувер), в своем докладе на конференции высказал свое понимание исследований микробиома как наиболее крупного научного проекта всех времен. 

Jens Nielsen, системный биолог технического Университета Чалмерса (Гетерборг), заявил, что гены кишечного микробиома являются лучшими предикторами диабета второго типа,  чем установленные факторы риска, такие как индекс массы тела. Другие спикеры представили данные, подтверждающие, что кишечный микробиом являются более точным биомаркером ожирения/сниженной массы тела, в сравнении с данными по геному человека. Rob Knight, микробиолог Колора?дского университе?та (Бо?улдер), выразил надежду на то, что данные исследований микробиома будут также эффективны при классификации воспалительных заболеваний кишечника, таких как болезнь Крона или неспецифический язвенный колит, где “градации более тонкие, и пациенты зачастую неправильно диагностируются”. 

В ходе конференции бурно обсуждались вопросы деления на энтеротипы, исследования которых были представлены в статье Nature в апреле 2011 года. Многими участниками конференции оспаривалось точное деление по превалированию определенных групп микроорганизмов. Manimozhiyan Arumugam (European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany), автор статьи по энтеротипам, представил данные исследования, проведенного повторно на 663 представителях Дании и Испании. Результаты показали, что род Methanobrevibacter совместно с Ruminococcus определяют третий энтеротип, и различия данного кластера и Bacteroides не четкие, в то время как энтеротип Prevotella по-прежнему явно дифференцируется. Тем не менее имеются альтернативные данные, продемонстрированные группой Дэна Найта, системного биолога Колора?дского университе?та в Бо?улдере. В исследованиях, проведенных на 1200 участниках каких либо четких разделений по типам не обнаружено. Решение данных разногласий имеет важное значение, так как в конечном итоге это имеет отношение к рискам развития заболеваний и особенностям метаболизма лекарственных препаратов. 

Как отметил ведущий спикер Конгресса Дуско Эрлих, метагеном различных людей различается существеннее, чем собственно геном. Различия генома человека составляют  0,1%, а в метагеноме могут достигать 50%, и чем выше вариабельность, тем выше вероятность обнаружения релевантных сигналов. Роб Найт отметил, что на микробиом легче оказывать влияние, чем на геном, современные фармацевтические компании предлагают тысячи соединений для подавления либо индукции роста различных групп микроорганизмов (антибиотики, пробиотики). Также особый интерес представляет разработка лекарственных средств оказывающих направленное действие. 

Ученые центра наук о жизни представили на конгрессе работу на тему: “Изучение свойств бактерий рода Lactobacillus , предствителей кишечной микробиоты”. В настоящий момент ведутся переговоры о вступлении Центра наук о жини в Международный Консорциум Human Microbiome.

Работа конгресса завершилась обсуждением будущего глобального проекта Human Microbiome и выступлениями представителей организаций, занимающихся коммерциализацией научных исследований. 

Подготовила Кушугуловой Алмагуль по материалам статьи: Gut microbial `enterotypes` become less clear-cut, Microbiome sequencing offers hope for diagnostics